Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms