Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XIRP2A4UGR9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms