Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms