Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms