Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SMIM3Q9BZL3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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