Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN23Q96B33 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms