Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TTC13Q8NBP0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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