Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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