Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms