Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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