Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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