Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRKAA1Q13131 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRKAA1Q13131 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRKAA1Q13131 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRKAA1Q13131 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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