Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms