Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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GCSHP23434 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GCSHP23434 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GCSHP23434 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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