Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BP0C0L5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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