Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF879B4DU55 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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