Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPEF1Q9Y4P9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPEF1Q9Y4P9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPEF1Q9Y4P9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms