Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms