Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q0

NAALAD2, N-acetylated-alpha-linked acidic dipeptidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAALAD2Q9Y3Q0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAALAD2Q9Y3Q0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAALAD2Q9Y3Q0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAALAD2Q9Y3Q0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAALAD2Q9Y3Q0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAALAD2Q9Y3Q0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms