Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAN1Q9Y2M0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAN1Q9Y2M0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms