Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms