Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF3Q9NR23 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms