Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NECTIN3Q9NQS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NECTIN3Q9NQS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms