Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms