Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM12Q9H4Q4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms