Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRDL1Q9BU40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRDL1Q9BU40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms