Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNT1Q96Q11 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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