Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRIQ1Q96JM4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
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