Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52L3Q96J77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms