Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP3Q96CW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms