Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPDL3BQ92485 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3BQ92485 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms