Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM3Q8NE01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms