Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSANTD4Q8NCY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms