Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSGALNACT2Q8N6G5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSGALNACT2Q8N6G5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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