Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI4Q8N135 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms