Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APLFQ8IW19 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms