Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD3Q86UT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms