Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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