Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN12Q6ZSI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms