Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD1Q6UWL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms