Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KANK3Q6NY19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KANK3Q6NY19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KANK3Q6NY19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms