Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD3Q5JSP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD3Q5JSP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms