Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIPR1Q53HC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIPR1Q53HC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms