Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRC23Q53EV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms