Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF3Q496Y0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LONRF3Q496Y0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms