Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HFEQ30201 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HFEQ30201 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HFEQ30201 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HFEQ30201 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HFEQ30201 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HFEQ30201 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HFEQ30201 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HFEQ30201 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HFEQ30201 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HFEQ30201 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HFEQ30201 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HFEQ30201 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HFEQ30201 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HFEQ30201 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HFEQ30201 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HFEQ30201 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HFEQ30201 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HFEQ30201 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HFEQ30201 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HFEQ30201 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms