Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP1Q15431 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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