Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC1AQ14683 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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