Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NID2Q14112 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NID2Q14112 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NID2Q14112 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NID2Q14112 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NID2Q14112 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NID2Q14112 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NID2Q14112 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NID2Q14112 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NID2Q14112 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NID2Q14112 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NID2Q14112 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NID2Q14112 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NID2Q14112 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NID2Q14112 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NID2Q14112 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NID2Q14112 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NID2Q14112 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NID2Q14112 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NID2Q14112 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NID2Q14112 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NID2Q14112 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NID2Q14112 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NID2Q14112 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NID2Q14112 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NID2Q14112 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NID2Q14112 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NID2Q14112 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NID2Q14112 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NID2Q14112 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NID2Q14112 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NID2Q14112 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NID2Q14112 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NID2Q14112 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NID2Q14112 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NID2Q14112 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NID2Q14112 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NID2Q14112 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NID2Q14112 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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