Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKP1Q13835 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP1Q13835 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms